Microbiome Database

Actinomyces israelii

A. israelii

Akkermansia muciniphila

A. muciniphila

Anelloviridae

Torque teno viruses (TTV)

Alistipes putredinis

A. putredinis

Anelloviridae

Anelloviruses

Aspergillus fumigatus

A. fumigatus

Bacillus subtilis

B. subtilis

Bacillus cereus

B. cereus

Bacteriophages

Phages

Acinetobacter baumannii

Bacteroides dorei

B. dorei

Bacteroides fragilis

B. fragilis

Bacteroides thetaiotaomicron

B. thetaiotaomicron

Bacteroides vulgatus

B. vulgatus

Bifidobacterium adolescentis

B. adolescentis

Bifidobacterium bifidum

B. bifidum

Bifidobacterium longum

B. longum

Bordetella pertussis

B. pertussis

Borrelia burgdorferi

B. burgdorferi

Burkholderia cepacia complex

B. cepacia complex (Bcc)

Campylobacter jejuni

C. jejuni

Candida albicans

C. albicans

Candida glabrata

C. glabrata

Candidatus Methanomassiliicoccus intestinalis

Ca. M. intestinalis

Candidatus Methanomethylophilus alvus

Ca. M. alvus

Candidatus Saccharibacteria

TM7

Clostridium butyricum

C. butyricum

Clostridioides difficile

C. diff

Clostridium difficile

C. diff

Clostridium perfringens

C. perfringens

Corynebacterium diphtheriae

Diphtheria bacillus

Corynebacterium jeikeium

Group JK corynebacterium

Collinsella aerofaciens

C. aerofaciens

Corynebacterium accolens

C. accolens

crAssphage

crAssphage

Cutibacterium acnes

C. acnes

Cutibacterium avidum

C. avidum

Debaryomyces hansenii

Debaryomyces hansenii

Deinococcus radiodurans

D. radiodurans

Eggerthella lenta

E. lenta

Enterococcus faecalis

E. faecalis

Enterococcus faecium

E. faecium

Escherichia coli

E. coli

Faecalibacterium prausnitzii

F. prausnitzii

Fusobacterium nucleatum

F. nucleatum

Gardnerella vaginalis

G. vaginalis

Haemophilus influenzae

H. influenzae

Helicobacter pylori

H. pylori

Herpesviridae

Human herpesviruses

Klebsiella pneumoniae

K. pneumoniae

Lactobacillus acidophilus

L. acidophilus

Lactobacillus rhamnosus

L. rhamnosus

Legionella pneumophila

L. pneumophila

Malassezia globosa

M. globosa

Malassezia restricta

M. restricta

Malassezia species

Malassezia

Methanobrevibacter smithii

M. smithii

Methanosphaera stadtmanae

M. stadtmanae

Micrococcus luteus

M. luteus

Lactobacillus casei/paracasei

L. casei

Mycobacterium leprae

Leprosy bacillus

Mycobacterium tuberculosis

M. tuberculosis

Mycoplasma pneumoniae

M. pneumoniae

Neisseria gonorrhoeae

Gonococcus

Neisseria meningitidis

Meningococcus

Neisseria subflava

N. subflava

Nitrososphaera viennensis

N. viennensis

Neisseria lactamica

N. lactamica

Nocardia asteroides

N. asteroides

Moraxella catarrhalis

M. catarrhalis

Oscillospira

Oscillospira

Papillomaviridae

Human papillomaviruses (HPV)

Porphyromonas gingivalis

P. gingivalis

Prevotella copri

P. copri

Prevotella melaninogenica

P. melaninogenica

Propionibacterium acnes

P. acnes, Cutibacterium acnes

Pseudomonas aeruginosa

P. aeruginosa

Roseburia intestinalis

Roseburia

Ruminococcus bromii

R. bromii

Polyomaviridae

Human polyomaviruses

Saccharomyces cerevisiae

Baker's yeast

Salmonella enterica

S. enterica

Shigella dysenteriae

S. dysenteriae

Staphylococcus aureus

S. aureus

Staphylococcus epidermidis

S. epidermidis

Staphylococcus hominis

S. hominis

Streptococcus mitis

S. mitis

Saccharomyces boulardii

S. boulardii

Streptococcus oralis

S. oralis

Streptococcus mutans

S. mutans

Streptococcus pneumoniae

Pneumococcus

Streptococcus pyogenes

Group A Streptococcus (GAS)

Streptococcus salivarius

S. salivarius

Synergistetes species

Synergistetes

Tannerella forsythia

T. forsythia

Treponema pallidum

T. pallidum

Veillonella parvula

V. parvula

Vibrio cholerae

V. cholerae

Treponema denticola

T. denticola

Yersinia pestis

Plague bacillus